ASMARPE mantiene coordinación interinstitucional con diferentes organizaciones siendo parte de:
- El Directorio del Capítulo BASC PERU (Business Alliance for Secure Commerce).
- La Comisión Especial de la Ventanilla Única de Comercio Exterior – VUCE.
- El Consejo de Calidad del Puerto del Callao.
- El Consejo Consultivo en Temas Aduaneros de la Superintendencia Nacional de Aduanas y de Administración Tributaria – SUNAT.
- Las reuniones periódicas de coordinación con organismos públicos, entre ellos figuran el Ministerio de Transportes y Comunicaciones – MTC, el Ministerio de Comercio Exterior y Turismo – MINCETUR, el Ministerio de Economía y Finanzas – MEF y la Autoridad Portuaria Nacional – APN; al igual que con las Comisiones de Transportes y Comercio Exterior del Congreso de la República.
- Las coordinaciones permanentes con Dubai Ports World Callao – DPWC y APM Terminals.
- Las coordinaciones, a nivel intergremial, con la Cámara de Comercio de Lima – CCL, Consejo Nacional de Usuarios de Distribución Física Internacional de Mercancías – CONUDFI, Sociedad de Comercio Exterior – COMEX, Asociación de Exportadores – ADEX, Asociación Peruana de Agentes Marítimos – APAM, Asociación Peruana de Operadores Portuarios – ASPPOR, entre otros.